PNAS:完整蟒蛇基因组
为了吞咽并消化整个猎物,缅甸蟒蛇(Burmesepython)能够在短时间内加快代谢,增大相应器官。近日有研究显示,蟒蛇的这种能力来自于基因的快速演化。
科学家们对缅甸蟒蛇和眼镜王蛇(KingCobra)的基因组进行了测序,首次向人们展示了完整且有注释的蛇类基因组。这项研究分为两篇文章,于十二月二日发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志上。
“脊椎动物拥有许多相同基因,表型上却存在很大差异,这样的演化机制是进化生物学的一个基础问题,”文章的第一作者,ToddCastoe说。“蛇是研究上述问题的理想模型,因为与其他脊椎动物相比,蛇具有许多极端的特性。”
缅甸蟒蛇有一个非凡的能力,生理重塑(physiologicalremodeling)。研究团队发现,在缅甸蟒蛇进食以后,其基因表达经历了巨大的改变,致使蟒蛇的心脏、小肠、肝脏和肾脏在24-48小时以内增大35-100%。同时,蟒蛇的代谢也显著增强。当消化完成后,上述器官可在几天内恢复正常大小。研究人员指出,理解蟒蛇的生理重塑,能为多种人类疾病研究提供关键性的线索。
“原本完全关闭的基因被打开,”文章的资深作者,科罗拉多大学医学院的DavidPollock教授说。“蛇能够吃下与自己一样大的动物,为了迅速消化食物,需要打开大量的基因。”
研究团队在数据库中,将蟒蛇和眼镜蛇的7,442个基因与其他两栖动物、爬行动物、鸟类和哺乳动物进行比对,用统计学方法寻找被正向选择的基因。他们发现,蛇类基因组中有数百个基因经历了正向选择。
这些基因的功能与蛇的极端特性有关,例如代谢、脊椎和头骨形状、细胞周期调控等。其中不少基因具有重要的医学意义。例如,蟒蛇基因组中的GAB1基因涉及了乳腺癌、黑素瘤和儿童白血病。
研究人员指出,除了单个基因及其表达的改变,蛇类的极端特征也和多基因家族的加倍或缺失有关。研究显示,蛇类基因组是脊椎动物中演化得最快的。
这项研究大大推动了比较系统基因组学的发展,通过比对多个物种的基因组,展现了整个基因互作系统的演化,有助于在分子水平进一步认识进化机制。
(生物通叶予)