玉米花期：一个主效位点的连锁和互作

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遗传，2012年1月23号

在先前的一项研究中，从玉米自交系F252开始，经过开花期进行7代选择，我们确定与开花期变异相关联的候选DNA片段的多态性。在本文里，我们分析了候选区域的特征，并确定了它的基本多态性。然后，我们结合QTL定位、关联定位和发育特征分析解剖了与负责表型变异的遗传机制。候选区域含有真核细胞起始因子（EIF-4A），并发现在EIF4A的3'UT区段之外包括了一段高水平的序列和结构变异，其中包含了几个转座子片断的插入序列。通过一个在候选区域的双等位位点的SNP（C / T），我们用317个玉米自交系证实了这段候选区域与开花期的变异乡关联。尽管在F252的遗传背景下T等位位点与晚开花相关，然而，在317个玉米自交系的评判组中，由于等位位点的变异与遗传背景之间的广泛互作，该位点与早开花相关，说明了基因之间的相互作用。我们还发现候选基因多态性对多种性状的多效性影响，包括开花期、株高和叶数。最后，我们能够在一个具有F252的遗传背景的杂合体（C / T）的后代中打破开花期和叶片数之间的关联，与连锁不平衡的因果基因位点一致。因此，我们提出一个紧密关联的基因群和它们之间的互作对开花期的表型变异有贡献。