科学家们成功绘制出单细胞中短链RNA分子的图谱

近日,刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的一项研究报告中,来自瑞典卡罗琳学院的研究人员通过研究成功在单个胚胎干细胞中测定了短链非编码RNA序列的绝对数量。当基因中的信息被使用时,比如当其编码蛋白质时,首先DNA会转录成为信使RNA来作为蛋白质制造的范本,我们的机体细胞中包含有大量的短链非编码RNA序列,这些序列并不能制造蛋白质,而且研究者也并不清楚这些RNA序列的功能,我们最熟知的就是miRNAs了,其能够同信使RNA相互作用,并且调节基因和细胞的功能。

这项研究中,研究者对单个细胞中的短链RNA序列图谱进行了绘制,此前对短链RNA分子的研究基于同时对许多细胞进行分析,而这往往很难研究短链RNA分子的具体功能。研究者Rickard Sandberg教授说道,我们对短链RNA分子仅仅局限于一般的认识,而且我们还绘制了关于短链RNA分子一般机制的图谱,但这并不能够阐明这些分子在不同类型细胞或疾病中所扮演的角色。

利用单细胞转录组学技术我们就能够测定单个细胞中短链RNA分子的绝对数量,从而进行更为深入的分析,文章中研究者利用了两种类型的胚胎干细胞进行研究,在其吸附到子宫内膜之前和之后研究者分别进行了相关的分析研究。研究者表示,他们能够在所有的细胞状态下对大量的小RNAs分子进行检测,包括miRNA和一些功能未知的tRNA和snoRNA分子,同时他们还发现在两种不同的细胞状态下大量miRNAs的表达并不相同。

研究者Omid Faridani说道,这是一项基础性研究,通过研究我们发现这种新型的转录组学技术能够发挥作用,当然在单个细胞中绘制短链RNA分子的水平只是我们鉴别短链RNA分子特殊功能的第一步,后期研究中我们还希望将该方法推广到临床应用中去。研究者非常感兴趣研究在胚胎发育期间短链RNA分子所扮演的角色,而且他们希望通过后期更为深入的探索将这种转录组学技术应用于鉴别哪些胚胎能够在最好的时机去发育,同时这或许也能够帮助改善当前的体外受精疗法的进行。


参考文献:

Omid R Faridani,Ilgar Abdullayev,,Fredrik Lanner& Rickard Sandberg.Single-cell sequencing of the small-RNA transcriptome.Nature Biotechnology (2016) doi:10.1038/nbt.3701



本文来源于:生物谷

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