华大基因、阿里云、英特尔三巨头聚首国家基因库 BGI Online新版正式发布

2016年11月3日,在第十一届国际基因组学(ICG-11)大会上,华大基因、阿里云、英特尔等行业巨头齐聚深圳国家基因库,举行了“漫步云端——BGI Online合作伙伴大会暨新版发布会”。

华大基因股份有限公司执行总裁尹烨、阿里巴巴集团副总裁孙炯、英特尔医疗和生命科学集团亚太区总经理李亚东出席大会。三方一致同意进一步深化合作,扩大一体化精准医疗平台的建设,实现从平台到应用的落地,并以此为目标签署了战略合作协议。

华大基因股份有限公司研发中心副总监、BGI Online平台负责人金鑫在大会上宣布BGI Online 1.5版正式发布。作为三方合作的重要成果,新版在基因数据传输、文件管理、开发环境、命令行工具等方面做了全面提升,共升级了6大功能模块、34个功能点,大幅提高了平台的可靠性与易用性。自上线以来,BGI Online开发团队已经在平台上部署了171个工具,38个流程,处理了近170T数据,全面支持国产临床级测序仪BGISEQ-500,显示出该平台对于基因数据“传、算、存、管”的卓越能力。新版也将开放注册,为更多的机构及个人用户提供服务。

作为云端生态的重要组成部分,发布会上重点介绍了BGI Online开发者社区的筹备工作,并举行了“2016 GCTA风云挑战赛”颁奖典礼。该挑战赛自2016年4月在“基因组云计算产业联盟”大会上宣布以来,受到行业内外众多参赛者以及媒体的关注,吸引了300余名参赛者参与,包含在校学生、高性能计算领域专业人员、生物信息服务公司研究人员等,涌现出了众多优秀作品,显示出BGI Online云端生态的强大生命力。

此外在大会期间,阿里云大数据资深研究员徐常亮还介绍了华大基因与阿里云数加在机器学习和大规模计算方面的合作成果,华大基因研究院疾病基因组研究实验室负责人张建国、华南理工大学教授蔡宏民分别介绍了其作为使用者和开发者在BGI Online平台上的体验。张建国提到,以前团队完成87个家系的分析需要花费15天的时间,现在在online上只需要24小时。今年4月,基于BGI Online平台,华大基因、阿里云和安徽医科大学在21小时47分12秒内完成了1000例人类全外显子组数据分析,实现了基因数据分析领域的“深圳速度”。为此,华大基因与阿里云共同宣布了2020计划,计划在2020年实现24小时内完成个人全基因组的样本处理、测序、数据分析与解读,以及制定个性化治疗方案等精准医疗主要过程,进而让精准医疗早日惠及大众,并将测序成本降到2000人民币。

对于此次发布的成果,尹烨表示:“新的生命时代已经扑面而来,随着华大基因研制的国产临床级测序仪BGISEQ-500等一系列仪器不断走向成熟,我们即将迎来以基因数据为代表的生命大数据的井喷。与阿里云、英特尔等战略合作伙伴在一起,就是要准备好分析和理解生命大数据的基础设施,通过合作伙伴之间的精诚合作,使BT与IT深度融合,共同迎接生命时代的到来。”

孙炯表示:“作为全球领先的公共计算平台,阿里云将持续致力于降低计算成本、提升计算效率,将基因服务变成普惠医疗服务,并带来后续无限可能,造福人类健康。我们也会与英特尔、华大基因携手,推动机器学习、人工智能在生命科学领域的探索。我们相信,生命科技和云计算、大数据以及人工智能的深度融合,让‘精准医疗造福人类’这个目标早日实现。”

“作为计算创新的引领者,英特尔一直推动技术发展,也格外重视相应技术在行业变革中重点应用,”李亚东表示:“我们正积极响应‘健康中国2030’,紧密携手华大基因和阿里云,运用云计算技术重构医学科学创新体系并搭造协作与交流平台,发挥科技创新和信息化的引领支撑作用,加速推动精准医疗开发云平台的应用方案落地实施。”

据了解,2015年10月22日,为加速新兴的精准医疗模式在中国落地的进程,助力医学、医疗和健康行业的企业、机构的发展,并为公众提供更精准、高效的医疗健康服务和更为个性化及优质的诊疗体验,英特尔公司、华大基因、阿里云计算有限公司在第十届国际基因组学大会上正式签署战略合作备忘录,宣布启动精准医疗开放云平台的共建工作。该平台将成为中国,乃至亚太地区首个定位精准医疗应用的云平台,也将是首个跨越行业边界,凝聚IT企业、基因和生命科学机构及公有云服务提供商合力铸就的精准医疗云平台。

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