金花茶CnBCH基因cDNA全长克隆及生物信息学分析

利用CODEHOP和RACE方法，从珍稀观赏植物金花茶(Camellia nitidissima)花瓣中克隆得到了β-胡萝卜素环羟化酶(β-carotene hydroxylase, BCH)基因的cDNA全长，命名为CnBCH。碱基序列分析结果表明，该CnBCH基因全长1 089 bp，包含58 bp的5'非翻译区(untranslated regions, UTR)、105 bp的3' UTR和927 bp编码308个氨基酸的开放阅读框。生物信息学分析表明，该基因编码的蛋白质为不稳定亲水性蛋白，分子量为34.42 kD，无信号肽，含有4个跨膜结构域，一个脂肪酸羟化酶超家族(FA_hydroxylase super family)功能结构域以及BCH功能结构域(PLN02601)；CnBCH二级结构以α-螺旋为主，其次为无规则卷曲，β-折叠所占比例最少。氨基酸序列比对分析结果显示，CnBCH与茄科、蔷薇科等植物BCH蛋白同源性都在70%以上，与柿树(Diospyros kaki T.) BCH同源性最高。本研究为进一步了解CnBCH基因的功能及其在金花茶花瓣类胡萝卜素合成中的作用提供了帮助。