青岛能源所与英伟达公司共建CUDA研究中心

日前，英伟达公司（NVIDIA）正式发布新一批高性能并行化计算架构CUDA（Compute Unified Device Architecture）研究中心和教育中心名单，中国科学院青岛生物能源与过程研究所与其共建的“CUDA研究中心（CRC, CUDA Research Center）”正式成立，共同合作开展基于CUDA高性能计算的生物信息学研究。

英伟达公司（NVIDIA）作为世界500强企业，是全球高性能并行计算技术行业的领军者，其与众多世界一流高校、科研机构合作，共同致力于大规模并行计算用于各领域研究。目前，该公司共在全球范围内建有300余家“CUDA研究中心”和“CUDA教学中心”，其中包括卡内基梅隆大学、杜克大学、加州大学洛杉矶分校等世界一流高校和科研院所，以及惠普等著名跨国企业。

基于近年来在生物能源与过程领域高性能计算的出色研究成果，青岛能源所单细胞研究中心与英伟达公司联合建立了国内第三家CUDA研究中心。该CUDA研究中心由单细胞中心生物信息学团队负责人宁康研究员主持，面向生物、能源和过程研究中遇到的一系列大数据分析和知识挖掘问题，开展基于并行化高性能计算的生物信息学和生物过程研究，通过利用GPGPU-CUDA架构体系作为技术支撑实现超大规模的生物信息计算与数据挖掘。

近3年，英伟达公司已累计无偿投入价值50万元人民币的硬件设备，并借此次CUDA研究中心成立之际，再次无偿投入10万余元硬件设备，以配合团队原有超算环境，使CUDA研究中心的高性能计算软硬件条件达到国内一流水平。在此基础上，生物信息学团队助理研究员苏晓泉等目前已开发多个基于GPGPU的并行化分析软件和方法，并发表了包括两篇Bioinformatics（生物信息学领域顶级杂志）论文在内的10余篇相关学术论文和10余项发明专利与软件著作权。

下一步，青岛能源所和英伟达公司将继续发挥在双方在生物信息学方法研发和高性能并行计算技术领域的优势，进一步拓展深化从生物单细胞到微生物群落层面的基础和应用研究，更好的服务于研究所“一二六”规划的实施。

（发布：杜晓萌）