我国科学家解析芥菜基因组结构和起源

日前,中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武科研团队与浙江大学张明芳研究团队联合完成了芥菜和黑芥基因组测序与序列解析,相关研究成果近期在线发表于《自然.遗传(Nature Genetics)》上。



芥菜属于芸薹属的一类重要蔬菜,包括榨菜、大头菜、雪里蕻等。芥菜由芸薹属的两个二倍体基本种白菜(A基因组)和黑芥(B基因组)通过杂交和基因组加倍形成,属于异源四倍体基因组(AABB)。通过测序分析,确定了芥菜的A基因组来源,揭示了芥菜多倍体基因组上同源基因的表达与选择机制。发现显著差异表达的同源基因具有更快的进化速率,且芥菜中菜用和油用类群的分化与同源基因差异表达相关,表明同源基因差异表达对多倍体演化起着重要作用。

在该研究中,王晓武团队负责完成了黑芥B基因组的测序,以及芥菜(AABB)和油菜(AACC)这两个异源四倍体A基因组来源分析的工作;分析发现,芥菜和油菜的A基因组来源不同,芥菜(AABB)的A基因组来源于白菜型油菜,油菜(AACC,C为甘蓝)的A基因组起源于欧洲芜菁。

芥菜和黑芥基因组的测序分析,将为芸薹属作物的系统比较研究提供基础数据,为芥菜类作物的优异基因资源挖掘和农艺性状改良打下基础。该研究是多个团队联合研究取得的一项重要成果,王晓武、程锋是论文的并列第一作者。

论文链接:www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.3657.html

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