蓖麻RcNHX2基因的克隆与生物信息学分析

液泡膜型钠氢逆向转运蛋白 (Tonoplast Na+/H+ antiporters, NHX)在植物耐盐方面具有重要意义。本研究利用RACE方法克隆了蓖麻RcNHX2基因的3'端和5'端片段。最后设计全长引物获得蓖麻RcNHX2全长序列，并对其进行生物信息学分析。结果表明，蓖麻液泡膜型钠氢逆向转运蛋白基因的cDNA完整的开放阅读框序列为1 626 bp，推测其可编码541个氨基酸；含有典型的液泡膜型钠氢逆向转运蛋白典型的Na+/H+交换泵(50NES52)和氨氯吡嗪咪的结合位点(84LFFIYLLPPI93)；存在12个跨膜结构域，属于跨膜蛋白；预测其定位于细胞质膜和液泡膜及内质网膜。