豆科六种牧草DNA条形码鉴定技术研究

DNA条形码技术是基于物种种内特异性和种间多样性利用一个或几个标准的DNA片段(DNA barcode)构建生物鉴别数据库。本研究根据GenBank中豆科牧草matK和rbcL基因的核苷酸序列，设计4对通用引物对豆科五个主要牧草属(苜蓿属Medicago、车轴草属Trifolium、红豆属Onobrychis、小冠花属Coronilla、野豌豆属Vicia)的六种牧草进行扩增。扩增产物进行测序和分析，筛选出六种牧草的四个标记位点5’端和3’端保守序列，并对各标记位点保守区内的核苷酸进行单核苷酸多态性(SNPs)的单倍型分析，数据表明： matK1、matK2、matK3均有5个单倍型，五个牧草属有其特有单倍型；rbcL基因有6个单倍型，车轴草属白三叶和红三叶有其特有单倍型。根据matK(matK1，matK2，matK3)和rbcL基因筛选的四个标记位点为六种牧草建立了相对应的特异DNA识别码。说明matK和rbcL组合后可作为豆科六种牧草的潜在条形码。