桑树MaGte4基因的克隆、表达及序列特征分析

Virp1基因是第一个被报道可以结合RNA的Bromodomain(BRD)蛋白，在马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid，PSTVd)对宿主的感染及其复制中起重要作用。本研究根据NCBI登录的virp1基因序列和桑树基因组数据库设计引物，进行RT-PCR扩增和克隆测序，获得桑树的同源MaGte4基因长1 771 bp的序列。生物信息学分析表明，基因有3个外显子，CDS长1 683 bp，编码560个氨基酸，有与乙酰化组蛋白赖氨酸具有特异相互作用的BRD及其extra-terminal(BET)结构域，且该结构及其氨基酸组成在各物种间比较保守，桑树MaGte4具有和virp1蛋白非常相似的C-末端区域，RT-PCR分析基因在正常和花叶型萎缩病桑树叶片、叶柄和叶脉中均有表达，推测MaGte4的功能可能和Virp1相类似。