气候变化相关的海洋微生物全基因组测序

海龟、鲸鱼等或许是充满魅力的海洋生物,然而真正主宰海洋、占据海洋生物质总量98%的却是肉眼难以看见的海洋微生物。这些海洋微生物种类繁多,包括微藻、病毒、细菌和古生菌,他们作为海洋食物链的基础,负责控制大部分海洋营养流和健康。

然而,人们对它们之间如何互动、如何承担海洋中的基本过程还知之甚少,特别是在深海、低氧水域,气候变化的影响也越来越显著。在这些区域,水温升高和循环减弱导致微生物加工过程超速,引发半数以上的可用氮(对所有海洋生命至关重要的营养)丢失。

最近,华盛顿大学的海洋学家团队揭示了生活在这些地区但却知之甚少的常见细菌的信息。他们通过培养和测序微生物的全基因组,发现了海洋微生物以一种新的、令人惊奇的方式从水中去除氮。研究成果发表在2016年7月19日出版的MultidisciplinaryJournal of Microbial Ecology期刊上。

该研究中所分析的细菌称为Candidatus Thioglobusautotrophicus,存在于世界各地的低氧水域,也是这些水域的主导生物之一,在一些区域占据生物细胞总量的40-60%。该细菌在从海洋中去除氮的过程中发挥了巨大的作用,但迄今为止,科学家们对这一过程也没有完整的认知,该研究则填补了这一空白。

他们的研究证实了该细菌导致氮损失,但与预期的方式不同。该微生物负责将硝酸盐转化为亚硝酸盐,然后亚硝酸盐继续负责其他脱氮过程。早先的研究推测,这些微生物也产生氨,而华盛顿大学的这项研究发现则恰恰相反,该微生物消耗氨,本质上是与其他生物竞争利用氮化合物。

该研究获得了美国NSF的资助,后续将分析该细菌对海洋碳和硫循环的调控作用。

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