新疆野扁桃AlsCBF1-A基因的克隆及生物信息学分析

以野扁桃为实验材料，提取叶片的RNA，设计基因特异性引物，利用RT-PCR克隆转录因子CBF的cDNA全长，命名为AlsCBF1-A (登录号KU975456)；并对起基因和蛋白进行了生物信息学分析。结果表明，该转录因子基因的CDS区长699bp，编码232个氨基酸，编码蛋白相对分子质量约为26.0272 kDa，PI 4.84；由无规则卷曲(C)，α-螺旋(H)，β-折叠(E)组成，分别占52.17%，21.74%和26.09%；有较强的亲水性，无跨膜区和信号肽存在，有8处丝氨酸磷酸化位点、2处苏氨酸磷酸化位点、2处酪氨酸磷酸化位点；同源性分析表明AlsCBF1-Ａ基因在高等植物中保守性较高。本研究显示CBF转录因子可能与野扁桃的抗寒性相关，此研究为野扁桃抗寒分子机理的进一步研究提供了帮助。