Macrogen千年基因携手多家单位启动中国花生基因组计划

生物通,2012-07-17

第十一届中国专利高新技术产品博览会签约仪式

由山东圣丰种业科技有限公司、广东省农业科学院作物研究所、山东省花生研究所、Macrogen千年基因等共同发起的中国花生基因组计划目前已全面启动，并在“第十一届中国专利高新技术产品博览会”上举行了盛大的签约仪式。该项目计划于全球范围内首次完成对花生A基因组的全基因组测序、组装及序列结果的注释。

第十一届中国专利高新技术产品博览会是由国家知识产权局、科学技术部、中国科学院、中国工程院、山东省人民政府共同主办的一次科技盛会，于6月26日-28日在济宁市曲阜孔子文化会展中心举办，共有27项合作项目在本次会议中成功签约，中国工程院院士李国杰、范云六及济宁市市长梅永红、市委副书记崔洪刚等共同见证了这些项目的签约。作为必将对中国农业的发展产生深远影响的花生基因组计划，在本次会议中得到了相关部门的广泛关注和大力支持。

花生（Arachis hypogaea L.）是世界上重要的油料作物和优质的植物蛋白源之一，我国的花生种植面积仅次于印度，总产位居世界第一。完成花生基因组的测序及遗传密码解析，将对花生的遗传育种及新品种改良具有重要的战略意义。此外，作物种质资源是国家生存和发展的战略性资源，作物种质资源保护是生物多样性保护的重要内容。由中国科学家启动中国花生基因组计划，将有利于对我国花生种质资源的保护。

花生栽培种（AABB）是异源四倍体，基因组由A基因组和B基因组组成，采用目前的测序技术直接进行测序组装是很困难的，容易造成序列拼接错误。前期研究结果表明，花生A基因组与B基因组的相似度达98%， A基因组所含的优质基因与B所含的优质基因基本是一致的。因此仅对花生A基因组进行测序即可挖掘相当数量的优质基因并开发大量分子标记，从而将研究结果应用于花生分子育种。

本项目的发起人之一广东省农科院梁炫强教授表示：“花生全基因组测序的结果将为其遗传改良提供重要的数据资源和平台，有助于科研人员从分子水平了解花生的生长、发育及繁殖过程，并对花生新品种的培育以及提高花生的产量、品质和抗病性等具有重要的意义”。花生体系首席科学家禹山林研究员以及本项目的主要资助企业山东圣丰种业公司的副总裁及科研总监李洪杰也表示：“本项目仅是花生基因组研究的开始，后期我们将开展更多的花生基因组重测序和花生转录组测序，以及花生B基因组和AABB基因组的测序，从而深入地揭示花生的遗传多样性及基因表达调控模式。”

Macrogen的中国项目总监于越表示：“很多植物基因组因为重复度和杂合度较高，对全基因组的序列组装提出了巨大的挑战。本项目的实验和分析工作将全部在Macrogen的标准实验室完成，我们计划将结合多种测序平台来完成花生基因组的组装，根据Macrogen大量的全基因组项目执行经验以及通过结合各测序平台的优势，我们非常有信心得出花生基因组高质量的序列图谱”。

关于千年基因：

千年基因以总部Macrogen作为强大的技术依托，主要致力于为研究人员提供最高质量标准的测序服务及相关技术支持。Macrogen集团由首尔大学于1997年成立，并于2000年成功上市，是世界领先的生物技术研发与应用企业，目前已经在亚洲、欧洲、美国等成立了多家分部。Macrogen同时拥有通过ISO9001 & ISO13485 & CLIA国际质量标准认证的大型基因组学实验室及多种高通量测序平台，包括4台Roche 454 & 454+、30台HiSeq2000、2台MiSeq、2台GAII、2台ABI SOLiD、1台Ion Torrent及几十台ABI 3730测序仪等。Macrogen已参与了白菜、玉米、马铃薯、辣椒、油棕榈、1,000人基因组、100,000人外显子组计划、第一个韩国人基因组计划、Asian Genome Road 等众多国际项目，其丰富的项目执行经验使各个测序平台的优势均能在Macrogen得到最佳体现。