北京基因组所合作研究解析橡胶树基因组

近日,国际学术刊物自然出版集团旗下子刊Nature Plants 发表了由中国科学院北京基因组研究所胡松年团队和中国热带农业科学院橡胶研究所唐朝荣团队合作完成的橡胶树基因组研究新成果,提出了橡胶物种进化和乙烯刺激产胶的新观点。该研究结果将极大推动产胶植物的产胶生物学研究,为橡胶树优异种质的发掘利用和高产优质抗逆遗传改良奠定良好基础。成果已入选Nature 杂志的研究亮点,在该刊最新一期的Research Highlights栏目下进行了重点报道。

天然橡胶是我国重要的战略物资和工业原料,因其良好的弹性、伸展性、耐老化等综合理化性能而具有不可替代性。我国天然橡胶年产量80万吨,但不足我国年消费量的20%,远低于国际公认的安全保障线(30%)。在两千多种产胶植物中,巴西橡胶树因其产量高、品质好、易采集和持续生产周期长等原因使之成为天然橡胶几乎唯一的商业来源。橡胶树为什么能高产橡胶,这种特性是否与其环境适应和进化相关,在生产上乙烯处理为何能显著增加橡胶产量?这些都是产胶生物学研究上长期悬而未决的重大理论问题。

2011年,北京基因组所与中国热带农业科学院橡胶所联合启动了橡胶树全基因组测序项目。橡胶树基因组庞大,具有高杂合、高重复的特点,对序列拼接组装和功能解析均构成巨大挑战,经过团队成员五年多的不懈努力和联合攻关,成功构建了一个高质量的橡胶基因组,拼接序列(1.37Gb,N50=1.28Mb)覆盖全基因组的93.8%;发现在橡胶树进化过程中,与产胶密切相关的REF/SRPP基因家族发生了显著扩增,并且发生了乳管细胞特异性功能分化,同乳管中大橡胶粒子的发生、橡胶高产性状密切相关,推测是橡胶树抗虫机制的重要组成部分,为橡胶物种进化的重要推动力。

论文链接

橡胶生物合成与REF/SRPP家族的扩增分化




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