科学家绘制出植物的遗传和表观遗传调控“景观”

发表日期：2016-05-28 10:13AM 阅览次数：

美国索尔克研究所的科学家们开发的新技术可以对调控蛋白的DNA区域快速绘图，该基因可以赋予一些植物耐旱、抗病能力。

解开此种称为“cistrome”的DNA区域的奥秘,同时就展示了植物控制何时何处进行基因表达的机制。

用以前方法绘制出植物细胞的cistrome，困难且缓慢,而新方法提供了一个关于遗传调控的关键方面的全面观点。

研究人员创建了一个系统,即在DNA文库中添加一个标记转录因子,让它绑定和隔离所有的DNA-蛋白质对子，然后利用该系统对cistrome开展图谱绘制。

该方法称为亲和纯化DNA测序(DAP-seq),可以扩大科学家对转录因子及其结合位点的更多信息的理解。

为了测试DAP-seq,研究人员绘制529个拟南芥的基因组转录因子,研究了270万个结合位点。

他们使用包含或不包含胞嘧啶甲基化的DNA重复了这个实验,约四分之三转录因子的绑定模式发生了改变。

结果表明不仅调控蛋白改变基因表达,而且外遗传性甲基化标记在这种调节中亦能起到类似的作用。