我所王国梁研究团队在基因组变异方面取得突破性进展

我所王国梁研究团队在病原菌和植物基因组变异方面取得突破性进展，发现了病原菌（以稻瘟病菌为例）和植物（以玉米为例）中几类活跃的转座子对基因组的变异和多样性起重要作用。研究成果以A novel method for identifying polymorphic transposable elements via scanning of high-throughput short reads为题，发表在院选核心期刊DNA Research (牛津大学出版系列杂志之一)上，康厚祥博士为第一作者，王国梁博士为通讯作者，植保所为第一完成单位。

变异是一切物种形成以及多样性演化的基础，其中有性繁殖是变异的主要来源之一。然而，大多数病原真菌具有比较严格的无性繁殖的过程，以无性繁殖为主的病原真菌怎样快速变异是未知的命题（这恰好是病原菌容易克服寄主抗性的主要原因之一）。康厚祥博士在研究稻瘟病基因组过程中无意发现几类活跃的转座子在病原菌变异中起重要的作用，以此为出发点，开发了一种基于高通量短序列鉴定活跃转座子的新方法，并将此方法开发成一套软件系统PTEMD，（在线获取网站http://www.kanglab.cn/blast/PTEMD_V1.02.htm ）。此方法在植物中也得到成功的应用，鉴定到玉米中68类多态性转座子家族，并证明了虽然LTR类型转座子构成占据了玉米大部分的基因组内容，但基因组中快速跳跃造成突变的依然是DNA类型的转座子。本方法将为病原菌、植物乃至动物基因组变异研究开辟一片新领域。

上述研究工作由中国农业科学院植物保护研究所与俄亥俄州立大学、密西根州立大学、湖南农业大学等单位合作共同完成，获得了国家自然科学基金青年基金项目、国家自然科学基金面上项目及973计划、美国自然科学基金项目等项目的共同资助。

论文链接：

http://dnaresearch.oxfordjournals.org/content/early/2016/04/19/dnares.dsw011.abstract